灌云县公安局是县人民政府主管全县社会治安工作的职能部门，主要职责是：贯彻执行党和国家关于公安工作的方针政策和法律法规，部署并指导、检查、监督全县公安工作；组织指挥、实施侦查工作；依法查处危害社会治安秩序行为，依法进行户口、居民身份证、枪支弹药、危险物品和特种行业等管理工作；依法组织实施出境、入境和外国人在本县居留、旅行的有关管理工作，组织实施边防治安管理工作；指导、监督并组织实施全县消防工作；维护道路交通安全、交通秩序以及机动车辆、驾驶员管理工作；组织指导对国家机关、社会团体、企事业单位和重点建设工程的治安保卫工作以及群众性治安保卫组织的治安防范工作；组织开展禁毒斗争，打击毒品违法犯罪活动；组织实施对信息网络的安全监察等工作。
县公安局目前内设办公室、指挥中心、政治处、纪委、警务保障室、科技信息通信科、档案科、信访科等职能科室，以及治安警察大队、水上警察大队、刑事警察大队、交通警察大队、经济犯罪侦查大队、国内安全保卫大队、巡特警大队、法制大队、警务督察大队、内保大队、食药环侦大队、禁毒大队、技侦大队、出入境管理大队、网络安全保卫大队、监所管理大队等直属行政机构；现有13个派出机构：伊山派出所、侍庄派出所、杨集派出所、东王集派出所、南岗派出所、龙苴派出所、小伊派出所、仲集派出所、同兴派出所、四队派出所、圩丰派出所、图河派出所、临港派出所。